Liitolla on seitsemän aluejärjestöä, joiden jäseniä alueen kaikki ammattiosastot ovat. Aluejärjestön vuosikokouksessa ammattiosastot valitsevat aluejärjestön hallituksen. Aluejärjestöt järjestävät koulutusta ja vapaa-ajan tapahtumia.

Elintarviketyöläisten Etelä-Suomen aluejärjestö
Elintarviketyöläisten Länsi-Suomen Aluejärjestö
Elintarviketyöläisten Häme-Keski-Suomen Aluejärjestö
Elintarviketyöläisten Kaakkois-Suomen Aluejärjestö
Elintarviketyöläisten Itä-Suomen Aluejärjestö
Elintarviketyöläisten Pohjanmaan Aluejärjestö
Elintarviketyöläisten Pohjois-Suomen Aluejärjestö

Jokaisen aluejärjestön alueella on SEL:n aluetoimisto, joka palvelee alueen jäseniä kaikissa työehto-, jäsenyys- ja työttömyysturva-asioissa.